O Mecanismo terá um Comité de Coordenação constituído por 1 representante por Estado da CPLP. Este Comité é responsável pela coordenação global da atividade do Mecanismo. Os membros do Comité de Coordenação serão indicados pelas estruturas associativas empresariais nacionais de cada país da CPLP e o seu mandato será de dois anos. Está neste momento a decorrer o processo de nomeação.

A CAL exerce o Secretariado do Mecanismo até eleição do Comité Coordenador que poderá decidir pela sua continuidade por períodos renováveis de 24 meses.